国家呼吸医学中心承担北京协和医学院、北京大学医学部、清华大学医学部、首都医科大学、北京中医药大学等医学院校的院校医学教育任务,并为国家住院医师规范化培训内科专业基地,国家呼吸与危重症医学(PCCM)专科医师规范化基地。近年来本中心培养多名研究生获评市级及各院校优秀毕业生称号,并有多名住培医师获评各级优秀住培医师。同时本中心承担首都医科大学多项教学课题。